馬士英則對這一切冷眼旁觀，宦海浮沉二十餘載，對於朝臣們的黨政他早已看穿。所謂的東林除了少部分幹臣之外，其餘的大部分都不過是趨炎附勢之徒，藉助於東林的名望和影響，滿足自己的個人目的。現在的朝堂，手中有兵權才是最重要的，劉良佐兩萬人馬。兵不血刃，便能輕易的攻克南京就充分的說明了這一點。

但出乎意料的是，剛剛安穩下來沒幾天，二月初五的時候，南京城中便出現了混亂的情況。劉良佐約束麾下的兵馬不利，入城時的劫掠並沒有完全消除。雖然馬士英嚴令他必須控制住麾下兵馬，不能再出現類似的情況，但卻是沒有達到預期的效果。

這一點，令劉良佐都很驚詫。麾下的兵馬不知道是怎麼一回事，居然有愈演愈烈的趨勢，從劫掠普通百姓，開始轉向南京城中的豪族、鄉紳，甚至於朝中的大臣。

劉良佐雖然是個武夫，但也知道。這個時候萬萬不能出什麼亂子。派出心腹糾察軍紀，徹查此事，卻是始終沒能得出一個確切的結果，但有一點可以肯定，似乎是有人在暗中推波助瀾，挑唆、慫恿自己計程車卒在城中搞出這麼多事情來。

訊息送到馬士英手中，馬士英頓時起了警覺，但想要徹底調查清楚。眼下又著實沒有能力。南京初定，朱由崧登基的事情邊讓馬士英焦頭爛額。還要想方設法將自己的弒君的事情一點一點的抹去，實在是殫精竭慮，忙的不亦樂乎。現下哪有時間來調查這樣的事情。

無可奈何之下，馬士英只得拜託盧九德，請京營負責南京城中的治安。但即便是如此，二月初五的晚上。仍是有十餘位大臣家中遭到了洗劫，搶劫財貨不說，還殺死了其中的五位朝臣。

偏偏這十餘人還都是東林一黨中的骨幹成員，如此一來，錢謙益、黃宗羲這些東林首領可是再也無法忍耐了。

凌晨時分。便有千餘名官員和儒生聚集到宮門之外，聲稱要嚴懲劉良佐和肇事兇手。馬士英少不得要四方奔走，好不容易才將事情給壓了下來。

但東林黨人卻將馬士英和劉良佐視為了死敵。

轉過天來，京師中發生了數起對抗事件，便是儒生和劉良佐的兵馬起了衝突，手無寸鐵的儒生吃了大虧，被殺的血流成河，兩百多條無辜的生命葬送在劉良佐的刀劍之下。

這樣一來，馬士英便再也無能為力了，只能眼睜睜的看著南京城中的局面一天比一天糟糕。這時候，他只能頻頻向黃得功、鄭芝龍和左夢庚發出書信，要他們日夜兼程，儘快趕至南京，平息城中的變亂。

但期盼中的援兵沒有到來，卻是得到了一個更加令馬士英崩潰的訊息。

朱平安在山東起兵，將朱由崧、馬士英等人列為叛逆，昭告天下他們的謀逆弒君之舉，山東軍楊廷麟數萬精銳之師開始南下。淮揚、江西、廣東紛紛響應，共推唐王朱聿鍵監國南京，各路人馬紛紛向南直隸一線挺進。

而其中最令人意想不到的是，福建鄭芝龍竟然頃刻間改換了門庭，加入到討逆大軍的行列中，舉兵七萬沿江北上。

山東軍嶽錦峰和仇澤兩部，從睢州一線向左夢庚發動進攻，左夢庚抵擋不住山東軍的炮火，只得退守鹿邑，依靠本身的十餘萬兵馬據城防守。

而楊廷麟所部也進入河南，聯合嶽錦峰和仇澤共擊左夢庚。左夢庚驚恐萬分，不斷向南京馬士英送來求救文書。可如今的馬士英哪有兵力可以派遣。

內憂外患，讓馬士英心力交瘁。

可遠在廬州的黃得功又在這個時候往馬士英的心上狠狠插了一刀。

二月初十的時候，黃得功宣佈起兵反正，與湖廣兵備道黃公輔一同進兵武昌，截斷了左夢庚的歸路。馬士英聞聽，頓時吐血不止。

朱由崧、阮大鋮、劉孔昭等人惶惶不可終日，不約而同的