大業九年八月，煬帝駕幸高陽。

楊廣聞說楊玄感叛軍已被撲滅，終於放下心事，因使大理卿鄭善果、御史大夫裴蘊、刑部侍郎骨儀與留守樊子蓋四人，推鞫楊玄感餘黨。

四人領旨稱諾，隋帝復對裴蘊囑道：楊玄感一呼而從者十萬，朕益知天下人不欲其多，多即相聚為盜耳。若不盡加誅戮，無以懲後，卿須識之。

因此裴蘊仰承帝意，皆以峻法治之。此事之後，煬帝見中原皆反，便啟駕往幸江都。

隋帝在江都坐猶未穩，黃門入報：今有山東章丘杜伏威、臨濟輔公袥率眾起事，轉向淮南，會合苗海潮、趙破陳等部，自稱將軍，聲勢大盛，進逼江都。

煬帝聞而大怒，便於江都調派兵馬，使葉萬緒為將，命限期撲滅各地叛軍。

葉萬緒奉旨，率兵進攻劉元進、朱燮、管崇等部，逼其退保黃山，然後圍剿。劉元進、朱燮逃跑，管崇被擒。葉萬緒斬殺管崇，及其將卒五千餘人，收其部眾子女三萬餘口。

煬帝復派江都丞王世充，發淮南兵數萬人進討劉元進。

王世充渡江進剿，頻戰皆捷，劉元進、朱燮敗死於吳郡，餘眾或降或散。王世充召降者焚香為誓，約不殺降，哄騙義軍餘眾歸降之後，全部坑於黃亭澗，死者三萬餘人。

因此劉元進餘黨復又相聚為亂，官軍遂不能討，以至隋亡。

大業十年，春二月，辛未。隋煬帝不顧天下盜賊蜂起，再詔百僚，議伐高麗。由是廷議數日，群臣無敢言者。戊子日，下詔復徵天下之兵，百道俱進。

九日之後，扶風賊帥唐弼便又起兵，自稱唐王，擁立李弘芝為天子，擁眾十萬。

三月，壬子，煬帝行幸涿郡，士卒在道亡者相繼。癸亥日到至臨渝宮，郊祭黃帝，斬叛逃軍士釁鼓，然而逃亡者更眾，不能遏止。

夏四月，榆林太守董純與彭城賊帥張大虎戰於昌慮，大破賊師，斬首萬餘。

五月，庚申日，延安賊帥劉迦論自稱皇王，建號大世，擁眾十萬。因與稽胡裡應外合，侵掠地方。煬帝時至北平，詔命左驍衛大將軍屈突通為關內討捕大使，發兵進擊劉迦論。

兩軍戰於上郡，屈突通斬獲劉迦論，及其部眾首級萬餘，俘獲男女數萬人返師。

當時天下已亂，隋朝所徵之兵大多失期不至，然而高麗亦因兩次大戰，以至困弊不堪。來護兒引軍前至畢奢城，高麗舉兵迎戰，被來護兒一戰而擊破。隋軍將直趨平壤，高麗王元大懼，遣使乞降，囚送主戰大臣斛斯政至朝。

隋煬帝聞而大悅，遂遣使持節，召來護兒還兵。

來護兒聞旨，大集眾將言道：我軍三出，未能平賊，此時若還，不可復來。勞而無功，吾竊恥之。今高麗實困，若以此眾擊之，不日可滅其國。我欲進兵徑圍平壤，生擒高元，獻捷而歸，不亦善乎！

眾將皆都鬨然稱是。來護兒於是答表請行，不肯奉班師詔命。

長史崔君肅固爭不可，來護兒言道：賊勢破矣，獨以相任，自足辦之。我今在閫外，事當專決，寧得高元還而獲譴。舍此成功，所不能矣！

崔君肅復告眾將：陛下脾性，何人不知！若從元帥違拒詔書，某必當聞奏，諸公則非但無功，皆應獲斬罪也。

諸將聞言而懼，俱至中軍，請元帥還兵。來護兒無奈，仰天長嘆，只得奉詔班師。

八月己巳，隋煬帝自懷遠鎮班師。有邯鄲賊帥楊公卿聞知，率其黨徒八千人抄襲車駕後衛第八隊，得飛黃上廄良馬四十二匹而去。

冬十月丁卯，天子駕至東都；十二日後，還至西京。

於是告祭太廟，命斬高麗使者及斛斯政，以為犧牲；並將斛斯政肉煮熟，饗以百官，有奸佞媚上之徒，竟食至飽。分肉之後，將斛斯政挫骨