述諸文所記，至正十四年，於有興已任掌教，至正十八年仍在掌教任中。此時離元亡已不到十年，他可能是玄教最末一代掌教了。

在玄教掌教的嬗遞過程中，逐漸形成了一套掌教傳承製度。主要的有：第一，除第一代掌教張留孫由元世祖直接任命外，其後的幾代掌教皆由前任掌教選定，推薦給皇帝，由皇帝降‘璽書‘加以任命。第二，繼任掌教在接任時，除必須有皇帝正式任命的‘璽書‘外，又須以張留孫遺下的大宗師印和寶劍相承傳，以為內部憑證。據袁桷《玄教大宗師家傳》記載，寶劍為至元十四年由元世祖所賜，上刻‘大元賜張上卿‘；印則是皇慶二年（1313）仁宗所賜，上刻‘玄教大宗師‘，手授曰：‘以是傳教俾永遠‘。這種以印、劍象徵教權的傳承辦法，是模仿歷代天師以張陵都功印和佩劍相傳承的制度而來。但玄教大宗師的印、劍都來自皇帝所賜，比張陵的印、劍更具有權威性。玄教掌教所受的璽書和印、劍，又明確表明其教權直接來自皇帝，他們可以憑藉這些象徵教權、皇權之物，自主地行使對該教派的管理權，不必再聽命於天師。因此，無論該教派所轄區域道官的任命、宮觀的建立，以及道士的吸收等，都是由玄教歷任掌教獨自處理。

玄教又有的組織領導體制。其首腦機關在大都崇真萬壽宮，最高首領是玄教大宗師。下設玄教嗣師、崇真萬壽宮提點、江淮荊襄道教都提點等職，以輔助大宗師工作。其下根據元朝的行政區劃，設立各級地方組織。路設道錄司，職其事者為道錄、道判；州設道正司，職其事者為道正、道判；

縣設威儀司，職其事者為威儀；最基層是宮觀，設住持、提點、提舉。可見其組織體系已經相當完備，這是多年經驗積累的結果。

玄教在元代雖然興盛，但它在道教理論上卻無建樹，倒是有不少弟子在儒學方面有相當造詣。其中以玄教第二代掌教吳全節最為突出。其師張留孫‘每與廷臣議論，及奏對上前，及於儒學之事，必曰：‘臣留孫之弟子全節深知儒學，可備顧問。‘是以武宗、仁宗之世，嘗yu使返初服，而置諸輔弼焉‘。④當時大儒吳澄也對吳全節的儒學十分稱讚，謂：‘吳真人全節寄跡道家，遊意儒術，明粹開豁，超出流俗。‘（吳澄《題吳真人封贈祖父誥詞後》）許有壬曾奉敕給吳全節的畫像寫讚語，其中有兩句雲：‘人以（公）為仙，我以（公）為儒。‘

（許有壬《特進大宗師閒閒吳公輓詩序》）吳全節自幼向空山道士雷思齊學《易》，對《易》學有相當修養；又十分推崇陸學，向文宗皇帝進陸九淵《語錄》。第三代大宗師夏文泳對‘三教九流之書無所不讀，而深明於先儒理學之旨。又嘗受《河圖》於隱者，有昔人未睹之秘。而於《皇極經世》之說，亦瞭然胸臆間‘。⑤在文學上有造詣的弟子則更多，如吳全節、陳義高、朱思本、陳日新、薛玄曦等，皆工詩能文，尤以詩著名當世。吳全節有詩集名《代祠稿》（現已不存）；陳義高有詩文集名《沙漠稿》《秋巖稿》《西遊稿》《朔方稿》（四庫全書現存其《陳秋巖詩集》二卷）；朱思本有詩文集名《貞一稿》（現存《委苑別藏》中）；陳日新詩文集不存；薛玄曦有侍集《上清集》《樵者問》（現僅《茅山志》存詩幾首）。他們的詩文皆博得當時許多詩文大家的好評。

玄教在修習方術上雜採兼收。除承襲龍虎宗的符籙齋醮外，雜採眾家。如吳全節既向南宗道士陳可復學雷法，又向東華派首領林靈真學道法，還向南宗道士趙淇學內丹。夏文泳對‘道法、齋科悉加考訂、折衷，下至醫藥、卜筮，莫不精究‘。⑥徐懋昭‘遊衡廬名山，遇真人授異書，能役鬼神致雷雨，祭星斗，弭災沴，所至，人迎候之唯恐不及‘。⑦陳日新‘道書丹經，大洞玉訣，靈寶黃籙齋科等書，皆極精詣。‘‘又能論人生甲子，推之以言其禍福壽天，奇中‘⑧。陳義