中又區分以現行賴耶和以種子賴耶為中心的窺基與圓測二系。

識分作九種之義。（一）即眼、耳、鼻、舌、身、意等六識，再加末那識（即第七識）、阿梨耶識（即阿賴耶識）（以上為八識）、阿摩羅識等，合為九識。小乘佛教立六識，大乘佛教地論宗、唯識宗立八識。真諦系之攝論宗復舉第九阿摩羅識（無垢識、真如識），成立九識義。據宗鏡錄卷四所釋，九識即：（一）眼識，眼與色為緣而生眼識，為能見者。（二）耳識，耳與聲為緣而生耳識，為能聽者。（三）鼻識，鼻與香為緣而生鼻識，為能嗅者。（四）舌識，舌與味為緣而生舌識，為能嘗者。（五）身識，身與觸為緣而生身識，為能覺者。（六）意識，意法為緣而生意識，能分別前五根所緣色等五塵境界。（七）末那識，又稱分別識。此識本無定體，即第八識之染分，依第八識自證分而生，緣第八識見分而執為我，為第六識之主，執轉第六識所緣善惡之境而成染淨者皆由此識。（八）阿賴耶識，意譯作藏識。此識染淨同源，生滅和合，具有相分、見分、自證分、證自證分等四分。（九）阿摩羅識，意譯作清淨識、白淨無垢識。此識乃一切眾生清淨本源心地，諸佛如來所證法身果德，在聖不增，在凡不減，非生死之能羈，非涅盤之能寂，染淨俱泯，湛若太虛。〔大乘密嚴經拘、卷下、大乘入楞伽經卷九、成唯識論述記卷一本、大乘法苑義林章卷一末〕

編輯本段第一能變識一、此阿賴耶識，約當體自相言，具三藏義，即雲藏識。

二、由過去善惡業習成熟之力，所感無記果報總報總主，是為異熟識。

三、此識一類無記，受前七識諸法之燻，持前七識諸法之種，現在未來前七諸法一切現行，皆由此識所藏種子發起，為一切種識。

四、此識能緣行相，極為微細。此識所緣五淨色根及諸種子，亦甚微細。此識所緣外器世間，難可測量。

五、此識所緣相分，執受勝義浮塵五根及諸種子，並依報世間。若於死位，此識最後捨去，若於生位，此識最先來執。

六、此識能緣見分，以了別為現行之相狀。

七、與觸、作意、受、想、思、遍行五心所，恆相應起。

八、此識行相極不可知，不能分別苦樂，故於三受，唯與舍受相應。

九、此識是善惡所招苦樂之果，體非善惡，又不與根隨煩惱相應，故於三性，是無覆無記。

十、觸等五個心所，亦如此識，惟是無覆無記性攝，亦屬異熟，所緣行相，亦不可知。

十一、此識無始以來，一類相續，常無間斷，是謂為恆。念念生滅，前後變異，是謂為轉。恆則非斷，轉則非常

阿賴耶識的功能分為四分：一、見分；二、相分；三、自證分；四、證自證分。

證自證分就是真如，就是唯一真心，也就是佛性。

自證分是未破無始無明而猶迷的佛性。即使佛性雖然在迷，但終究能夠證道，即自體自證自用，所以叫做自證分。

相分是由於真如不守自性，妄動而自生疑，迷住了本來智光圓明